| Kalmthoutse Heide (BE2100015) | Habitats | 2 049 ha | 2 |
| Klein en Groot Schietveld (BE2100016) | Habitats | 2 279 ha | 5 |
| Bos- en heidegebieden ten oosten van Antwerpen (BE2100017) | Habitats | 5 190 ha | 18 |
| Het Blak, Kievitsheide, Ekstergoor en nabijgelegen Kamsalamanderhabitats (BE2100019) | Habitats | 696 ha | 4 |
| Heesbossen, Vallei van Marke en Merkske en Ringven met valleigronden langs de Heerlese Loop (BE2100020) | Habitats | 670 ha | 3 |
| Vennen, heiden en moerassen rond Turnhout (BE2100024) | Habitats | 3 604 ha | 6 |
| Valleigebied van de Kleine Nete met brongebieden, moerassen en heiden (BE2100026) | Habitats | 4 839 ha | 15 |
| Bovenloop van de Grote Nete met Zammelsbroek, Langdonken en Goor (BE2100040) | Habitats | 4 275 ha | 10 |
| Historische fortengordels van Antwerpen als vleermuizenhabitats (BE2100045) | Habitats | 365 ha | 16 |
| De Maten (BE2200028) | Habitats | 530 ha | 3 |
| Vallei- en brongebieden van de Zwarte Beek, Bolisserbeek en Dommel met heide en vengebieden (BE2200029) | Habitats | 8 237 ha | 8 |
| Mangelbeek en heide- en vengebieden tussen Houthalen en Gruitrode (BE2200030) | Habitats | 3 724 ha | 5 |
| Valleien van de Laambeek, Zonderikbeek, Slangebeek en Roosterbeek met vijvergebieden en heiden (BE2200031) | Habitats | 3 597 ha | 5 |
| Hageven met Dommelvallei, Beverbeekse heide, Warmbeek en Wateringen (BE2200032) | Habitats | 1 963 ha | 4 |
| Abeek met aangrenzende moerasgebieden (BE2200033) | Habitats | 2 499 ha | 5 |
| Itterbeek met Brand, Jagersborg en Schootsheide en Bergerven (BE2200034) | Habitats | 1 855 ha | 5 |
| Mechelse heide en vallei van de Ziepbeek (BE2200035) | Habitats | 3 712 ha | 3 |
| Plateau van Caestert met hellingbossen en mergelgrotten (BE2200036) | Habitats | 130 ha | 1 |
| Uiterwaarden langs de Limburgse Maas en Vijverbroek (BE2200037) | Habitats | 771 ha | 5 |
| Bossen en kalkgraslanden van Haspengouw (BE2200038) | Habitats | 2 581 ha | 12 |
| Voerstreek (BE2200039) | Habitats | 1 578 ha | 1 |
| Jekervallei en bovenloop van de Demervallei (BE2200041) | Habitats | 625 ha | 4 |
| Overgang Kempen-Haspengouw (BE2200042) | Habitats | 688 ha | 4 |
| Bosbeekvallei en aangrenzende bos- en heidegebieden te As-Opglabbeek-Maaseik (BE2200043) | Habitats | 562 ha | 4 |
| Bossen en heiden van zandig Vlaanderen: oostelijk deel (BE2300005) | Habitats | 3 356 ha | 12 |
| Schelde- en Durme-estuarium van de Nederlandse grens tot Gent (BE2300006) | Habitats | 8 860 ha | 25 |
| Bossen van de Vlaamse Ardennen en andere Zuidvlaamse bossen (BE2300007) | Habitats | 5 484 ha | 25 |
| Bossen van het zuidoosten van de Zandleemstreek (BE2300044) | Habitats | 1 776 ha | 16 |
| Zoniënwoud (BE2400008) | Habitats | 2 739 ha | 4 |
| Hallerbos en nabije boscomplexen met brongebieden en heiden (BE2400009) | Habitats | 1 816 ha | 8 |
| Valleigebied tussen Melsbroek, Kampenhout, Kortenberg en Veltem (BE2400010) | Habitats | 1 432 ha | 7 |
| Valleien van de Dijle, Laan en IJse met aangrenzende bos- en moerasgebieden (BE2400011) | Habitats | 4 025 ha | 9 |
| Valleien van de Winge en de Motte met valleihellingen (BE2400012) | Habitats | 2 226 ha | 9 |
| Demervallei (BE2400014) | Habitats | 4 869 ha | 12 |
| Duingebieden inclusief IJzermonding en Zwin (BE2500001) | Habitats | 3 731 ha | 10 |
| Polders (BE2500002) | Habitats | 1 858 ha | 12 |
| Westvlaams Heuvelland (BE2500003) | Habitats | 1 854 ha | 5 |
| Bossen, heiden en valleigebieden van zandig Vlaanderen: westelijk deel (BE2500004) | Habitats | 3 030 ha | 13 |
| Kalmthoutse Heide (BE2100323) | Oiseaux | 2 167 ha | 2 |
| De Zegge (BE2100424) | Oiseaux | 86 ha | 1 |
| De Maatjes, Wuustwezelheide en Groot Schietveld (BE2101437) | Oiseaux | 4 074 ha | 5 |
| Arendonk, Merksplas, Oud-Turnhout, Ravels en Turnhout (BE2101538) | Oiseaux | 7 005 ha | 5 |
| De Ronde Put (BE2101639) | Oiseaux | 5 365 ha | 4 |
| Bokrijk en omgeving (BE2200525) | Oiseaux | 785 ha | 3 |
| De Maten (BE2200626) | Oiseaux | 562 ha | 3 |
| Mechelse Heide en de Vallei van de Ziepbeek (BE2200727) | Oiseaux | 2 324 ha | 2 |
| Bocholt, Hechtel-Eksel, Meeuwen-Gruitrode, Neerpelt en Peer (BE2217310) | Oiseaux | 9 776 ha | 5 |
| Militair domein en de vallei van de Zwarte Beek (BE2218311) | Oiseaux | 8 829 ha | 7 |
| Het Vijvercomplex van Midden-Limburg (BE2219312) | Oiseaux | 2 545 ha | 3 |
| Houthalen-Helchteren, Meeuwen-Gruitrode en Peer (BE2220313) | Oiseaux | 2 828 ha | 3 |
| Hamonterheide, Hageven, Buitenheide, Stamprooierbroek en Mariahof (BE2221314) | Oiseaux | 13 024 ha | 8 |
| De Demervallei (BE2223316) | Oiseaux | 6 398 ha | 8 |
| De Kuifeend en de Blokkersdijk (BE2300222) | Oiseaux | 193 ha | 1 |
| Krekengebied (BE2301134) | Oiseaux | 780 ha | 2 |
| Durme en de middenloop van de Schelde (BE2301235) | Oiseaux | 4 155 ha | 15 |
| Schorren en polders van de Beneden-Schelde (BE2301336) | Oiseaux | 7 018 ha | 4 |
| De Dijlevallei (BE2422315) | Oiseaux | 1 239 ha | 4 |
| Westkust (BE2500121) | Oiseaux | 1 110 ha | 3 |
| IJzervallei (BE2500831) | Oiseaux | 5 089 ha | 5 |
| Poldercomplex (BE2500932) | Oiseaux | 9 672 ha | 8 |
| Het Zwin (BE2501033) | Oiseaux | 1 897 ha | 1 |
| Kustbroedvogels te Zeebrugge-Heist (BE2524317) | Oiseaux | 491 ha | 2 |